داستان بازی Watch Dogs 2 همچون رگباری از احساسات عمیق و پیچیدگی‌های ذهنی است که در هر گوشه‌ای از شهر مدرن نهفته است. روایت داستان در این نسخه جدید با دقتی خارق‌العاده و نوآوری‌های بی‌سابقه، به بازیکن اجازه می‌دهد تا در لحظاتی نفس‌گیر، همراه با شخصیت‌های چندبعدی و پر از زندگی قدم بردارد و در معماهای پیچیده جامعه مدرن فرو برود. شخصیت اصلی داستان، که نماد جوانی و شور آزادی است، در فضایی از رمز و راز و درگیری‌های اخلاقی غرق شده و تلاش می‌کند تا از قدرت‌های مطلق سیستم‌های نظارتی و دیکتاتوری‌های دیجیتال بگریزد.