داستان بازی The Last of Us Part I پیرامون دو شخصیت اصلی یعنی جوئل و الی می‌چرخد. جوئل، مردی است که در طول سال‌ها تجربه از دست دادن عزیزانش را داشته و سختی‌های فراوانی کشیده و از نظر احساسی بسیار زخم‌خورده است. الی، دختری نوجوان که در برابر یک بیماری مرگبار که بشریت را تقریباً نابود کرده، مصونیت دارد. بازی ترکیبی از رابطه عمیق و پیچیده بین این دو شخصیت است که به‌مرور شکل می‌گیرد و در طول سفرشان، شاهد رشدشان هستیم. دنیای بازی بسیار تاریک و ناامیدکننده است، اما رابطه‌ای که بین این دو نفر شکل می‌گیرد، نور امیدی را در میان این ویرانی‌ها نمایان می‌کند.