داستان بازی Hitman همواره حول محور مأموریت‌های مختلف مأمور 47 در سراسر جهان می‌چرخد و در هر نسخه، یک خط داستانی پیچیده با شخصیت‌های مختلف، توطئه‌ها و چالش‌های متعددی را ارائه می‌دهد. مأمور ۴۷ که یک قاتل حرفه‌ای اصلاح‌شده از لحاظ ژنتیکی است، توسط سازمانی به‌نام ICA (International Contract Agency) برای ترور اهداف مختلف در سراسر جهان استخدام می‌شود. گذشته او مبهم است و به‌مرور زمان، اطلاعات بیشتری درباره منشا او و چگونگی تبدیل شدنش به یک قاتل بی‌رحم فاش می‌شود.